Šarapatka, B. (2013): Vybrané kapitoly z pedologie a ochrany půdy. Vydavatelství Univerzity Palackého v Olomouci, Olomouc, 92 pp.
Šarapatka, B. a kol. (2010): Agroekologie, východiska pro udržitelné zemědělské hospodaření. Bioinstitut, o.p.s., Olomouc.
Šarapatka, B., Niggli, U. a kol. (2008): Zemědělství a krajina: cesty k vzájemnému souladu. Palacky University Olomouc, Olomouc, 272 pp.
Šarapatka, B., Prax, A. (eds.) (2000): Úloha a využití výsledků pedologie v ekologii se zaměřením na agroekologii. UP, Olomouc.
Šarapatka, B., Tuf, I.H. (2010): Půda jako oživený subsystém. In: Šarapatka, B. a kol.: Agroekologie, východiska pro udržitelné zemědělské hospodaření. Bioinstitut, o.p.s., Olomouc: 161-178.